Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms