Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms