Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms