Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms