Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms