Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GabpaQ00422 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms