Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stx2Q00262 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms