Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp9bP98195 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms