Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cds1P98191 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cds1P98191 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cds1P98191 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms