Protein–RNA interactions for Protein: P97953

Vegfc, Vascular endothelial growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfcP97953 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfcP97953 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfcP97953 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfcP97953 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfcP97953 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfcP97953 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfcP97953 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfcP97953 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfcP97953 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfcP97953 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfcP97953 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfcP97953 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfcP97953 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VegfcP97953 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
VegfcP97953 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfcP97953 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfcP97953 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfcP97953 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms