Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Scn1bP97952 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Scn1bP97952 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Scn1bP97952 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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