Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfdP97946 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfdP97946 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfdP97946 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfdP97946 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms