Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata5P97489 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata5P97489 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata5P97489 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata5P97489 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata5P97489 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gata5P97489 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata5P97489 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata5P97489 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata5P97489 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata5P97489 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata5P97489 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata5P97489 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata5P97489 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms