Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bop1P97452 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bop1P97452 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bop1P97452 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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