Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mesp1P97309 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms