Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccl21cP86793 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccl21cP86793 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccl21cP86793 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccl21cP86793 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ccl21cP86793 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ccl21cP86793 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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