Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms