Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms