Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx1P81068 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx1P81068 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx1P81068 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx1P81068 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx1P81068 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Irx1P81068 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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