Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx2P81066 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx2P81066 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx2P81066 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx2P81066 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx2P81066 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx2P81066 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx2P81066 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx2P81066 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx2P81066 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx2P81066 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx2P81066 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx2P81066 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms