Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptprn2P80560 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms