Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx1P80205 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx1P80205 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx1P80205 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx1P80205 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx1P80205 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms