Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms