Protein–RNA interactions for Protein: P70441

Slc9a3r1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r1P70441 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r1P70441 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r1P70441 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms