Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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