Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx3P70354 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx3P70354 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx3P70354 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx3P70354 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx3P70354 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx3P70354 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx3P70354 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx3P70354 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx3P70354 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx3P70354 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx3P70354 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx3P70354 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms