Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1P70338 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms