Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms