Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cux2P70298 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cux2P70298 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cux2P70298 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cux2P70298 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cux2P70298 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cux2P70298 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Cux2P70298 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cux2P70298 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms