Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms