Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfixP70257 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfixP70257 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfixP70257 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfixP70257 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfixP70257 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfixP70257 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfixP70257 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfixP70257 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfixP70257 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfixP70257 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfixP70257 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfixP70257 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfixP70257 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfixP70257 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfixP70257 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfixP70257 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfixP70257 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NfixP70257 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NfixP70257 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NfixP70257 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfixP70257 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfixP70257 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NfixP70257 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfixP70257 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfixP70257 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfixP70257 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfixP70257 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfixP70257 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfixP70257 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfixP70257 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfixP70257 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfixP70257 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfixP70257 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfixP70257 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfixP70257 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfixP70257 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfixP70257 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfixP70257 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfixP70257 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NfixP70257 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfixP70257 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfixP70257 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfixP70257 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfixP70257 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfixP70257 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfixP70257 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NfixP70257 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfixP70257 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfixP70257 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfixP70257 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfixP70257 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfixP70257 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfixP70257 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfixP70257 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfixP70257 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfixP70257 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfixP70257 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfixP70257 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfixP70257 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfixP70257 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfixP70257 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfixP70257 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfixP70257 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfixP70257 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfixP70257 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NfixP70257 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfixP70257 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfixP70257 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NfixP70257 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfixP70257 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NfixP70257 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NfixP70257 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
NfixP70257 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfixP70257 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfixP70257 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfixP70257 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfixP70257 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfixP70257 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfixP70257 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfixP70257 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfixP70257 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfixP70257 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfixP70257 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfixP70257 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfixP70257 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NfixP70257 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfixP70257 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NfixP70257 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfixP70257 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfixP70257 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfixP70257 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfixP70257 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfixP70257 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfixP70257 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfixP70257 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfixP70257 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NfixP70257 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfixP70257 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfixP70257 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms