Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms