Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SbdsP70122 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SbdsP70122 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SbdsP70122 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SbdsP70122 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SbdsP70122 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SbdsP70122 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbdsP70122 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbdsP70122 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbdsP70122 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms