Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn5P68500 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms