Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps17P63276 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps17P63276 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps17P63276 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps17P63276 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps17P63276 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps17P63276 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps17P63276 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps17P63276 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps17P63276 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps17P63276 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms