Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PtnP63089 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtnP63089 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtnP63089 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtnP63089 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PtnP63089 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtnP63089 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtnP63089 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtnP63089 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtnP63089 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtnP63089 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtnP63089 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtnP63089 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtnP63089 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtnP63089 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PtnP63089 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtnP63089 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtnP63089 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtnP63089 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtnP63089 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtnP63089 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtnP63089 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtnP63089 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtnP63089 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtnP63089 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtnP63089 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtnP63089 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtnP63089 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtnP63089 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtnP63089 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtnP63089 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtnP63089 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtnP63089 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtnP63089 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtnP63089 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtnP63089 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtnP63089 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtnP63089 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtnP63089 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtnP63089 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtnP63089 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtnP63089 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtnP63089 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtnP63089 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtnP63089 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtnP63089 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtnP63089 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtnP63089 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtnP63089 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtnP63089 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtnP63089 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtnP63089 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PtnP63089 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtnP63089 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtnP63089 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtnP63089 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtnP63089 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtnP63089 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtnP63089 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtnP63089 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtnP63089 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtnP63089 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtnP63089 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtnP63089 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtnP63089 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtnP63089 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtnP63089 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtnP63089 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtnP63089 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtnP63089 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtnP63089 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtnP63089 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtnP63089 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtnP63089 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtnP63089 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtnP63089 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtnP63089 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtnP63089 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtnP63089 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtnP63089 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtnP63089 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtnP63089 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtnP63089 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtnP63089 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtnP63089 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtnP63089 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtnP63089 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtnP63089 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtnP63089 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtnP63089 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtnP63089 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtnP63089 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtnP63089 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtnP63089 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtnP63089 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtnP63089 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtnP63089 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtnP63089 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtnP63089 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtnP63089 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms