Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crabp1P62965 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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