Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps3P62908 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps3P62908 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps3P62908 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps3P62908 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms