Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf6P62331 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf6P62331 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf6P62331 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf6P62331 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Arf6P62331 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf6P62331 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf6P62331 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf6P62331 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf6P62331 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Arf6P62331 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Arf6P62331 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms