Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms