Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps13P62301 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps13P62301 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps13P62301 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps13P62301 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms