Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms