Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Polr2fP61219 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr2fP61219 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms