Protein–RNA interactions for Protein: P61213

Arl4a, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl4aP61213 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arl4aP61213 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arl4aP61213 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arl4aP61213 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arl4aP61213 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arl4aP61213 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arl4aP61213 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arl4aP61213 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms