Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms