Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snap25P60879 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap25P60879 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap25P60879 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap25P60879 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snap25P60879 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms