Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rin3P59729 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rin3P59729 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rin3P59729 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rin3P59729 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rin3P59729 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms