Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3bP59470 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms