Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup43P59235 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup43P59235 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup43P59235 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup43P59235 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup43P59235 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup43P59235 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup43P59235 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup43P59235 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms