Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubgcp3P58854 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms